La compagnie fut fondée dès 1927 avec un siège social situé à Berlin à la suite de la fusion de deux compagnies allemandes: la Deutsche Aero Lloyd et la Junkers Luftverkehr le 6 janvier de cette même année. Le nom initial de la compagnie fut à l'origine Deutsche Luft Hansa Aktiengesellschaft avant d'être rebaptisée en Lufthansa (Luft signifiant en allemand air/aérien et Hansa par référence à l'ancienne Ligue hanséatique qui était aux temps médiévaux une organisation marchande de l'Europe du nord).
Dans les années 1950, la RFA et la RDA se disputèrent le nom de la compagnie afin de l'intégrer à la leur. C'est finalement la RFA qui rétablira la Lufthansa après la Seconde Guerre mondiale, la
RDA fondant la sienne sous le nom de
Interflug (qui cessa ses opérations en 1991 après la réunification).
La compagnie fut la première compagnie non-américaine à lancer un nouveau modèle de Boeing. Ce fut ainsi le cas avec le Boeing 737 dont la Lufthansa fut le client de lancement en 1967 avec la version 737-100. Le 17 mai 2004, elle fut aussi inauguratrice du tout nouveau de système de connexion en vol de Boeing.
Dès 1992 l'État allemand commença la privatisation de la compagnie qui s'acheva en 1997 lorsqu'elle devint totalement privée. Son hub principal est l'Aéroport international de Francfort mais qui doit se désengorger notamment grâce au nouveau terminal de l'Aéroport international de Munich Franz Josef Strauß. Son siège social se trouve aujourd'hui à Cologne. Le 22 mai 2005, la Lufthansa acquit Swiss International Air Lines, faisant de l'Aéroport de Zurich son 3e hub, le premier à l'extérieur.
Voici la flotte de Lufthansa en avril 2007:
_18 Avro RJ85
_7 CRJ-900
_20 CRJ-700
_41 CRJ-100/200
_18 Airbus A319-100
_36 Airbus A320-200
_26 Airbus A321-100/200
_10 Airbus A330-300
_14 Airbus A300-600
_28 Airbus A340-300
_19 Airbus A340-600 (compagnie de lancement de l'appareil, encore 5 en commande)
_15 Airbus A380-800 (commandés pour 2008)
_19 MD-11F (uniquement en version cargo)
_33 Boeing 737-300
_30 Boeing 737-500
_1 Boeing 737-700
_30 Boeing 747-400
_20 Boeing 747-8I (commandés pour 2010)
Site de la Lufthansa